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課程名稱 |
生物資訊導論
Introduction to Bioinformatics |
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開課學期 |
107-2 |
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授課對象 |
醫學院 醫學院暨公共衛生學院共同課程 |
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授課教師 |
曾宇鳳 |
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課號 |
md&ph5070 |
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課程識別碼 |
420 U3010 |
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班次 |
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學分 |
1.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期三6(13:20~14:10) |
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上課地點 |
基醫509 |
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備註 |
本課程中文授課,使用英文教科書。醫學校區研究所共同課程。生物資訊導論僅為生物資訊學之第1小時課程主題講解。與詹迺立、蔡孟勳、范怡琴、歐陽彥正合授
總人數上限：60人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1072mdph5070_ |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用，以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力，有效解決生醫研究上資料分析，生物醫學資料庫應用分析，以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號：MD&PH5028，課程識別碼：420 U3010，1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼：922 U0370，3學分)之第一小時課程主題講解部份，並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習，請改修習生物資訊學。 |
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課程目標 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用，以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力，有效解決生醫研究上資料分析，生物醫學資料庫應用分析，以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號：MD&PH5028，課程識別碼：420 U3010，1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼：922 U0370，3學分)之第一小時課程主題講解部份，並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習，請改修習生物資訊學。 |
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課程要求 |
待補 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
待補 |
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參考書目 |
1. Introduction to Bioinformatics," Arthur M. Lesk, Oxford, 2002
2. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis," David W. Mount, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Lab. Press
3. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette, Wuket Kussm, 3rd Edition |
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評量方式
(僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
2/20 |
Introduction of bioinformatics (曾宇鳳 老師) |
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第2週 |
2/27 |
Sequence analysis 1 ( 范怡琴 老師) |
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第3週 |
3/06 |
Sequence analysis 2 ( 范怡琴 老師) |
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第4週 |
3/13 |
Gene expression (蔡孟勳 老師) |
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第5週 |
3/20 |
Gene expression 2 (蔡孟勳 老師) |
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第6週 |
3/27 |
Gene expression 3 (蔡孟勳 老師) |
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第7週 |
4/03 |
台大溫書假(放假) |
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第8週 |
4/10 |
Genome analysis (SNP) (蔡孟勳 老師) |
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第9週 |
4/17 |
Midterm 1 (13:30~14:30) |
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第10週 |
4/24 |
Phylogentics analysis (曾宇鳳 老師) |
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第11週 |
5/01 |
Genome analysis (蔡孟勳 老師) - Challenges & Strategies for NGS Data Analysis 蘇中才 博士 |
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第12週 |
5/08 |
Data mining 1 (歐陽彥正 老師) |
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第13週 |
5/15 |
Data mining 2 (歐陽彥正 老師) |
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第14週 |
5/22 |
Midterm 2 (13:30~14:30) |
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第15週 |
5/29 |
Structural bioinformatics (曾宇鳳 老師) |
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第16週 |
6/05 |
Structural bioinformatics (詹迺立 老師) |
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第17週 |
6/12 |
Bioinformatics database (曾宇鳳 老師) |
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第18週 |
06/19 |
Final exam (13:30~14:30 @ 102講堂) |
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